Aker Topphåndball ble stiftet 21. april 2016 basert på en felles avtale mellom Njård IL og Ullern IF. Moderklubbene ble enige om å forene sine elitesatstninger på håndball i en ny klubb, slik at moderklubbenes håndballsatsninger kan fokusere på barn, ungdom og voksne i lavere i divisjoner.

I sin første sesong, 2016/17, har klubben overtatt Njårds lag/plass i 1. divisjon kvinner, og tilsvarende Ullerns lag/plass i 2. divisjon kvinner. I tillegg har klubben junior elite/J18 med fokus på Lerøyserien.