Los Protectores de la Ciencia son un grupo de defensores del planeta de Cerebronia. Ellos ayudan y protegen a las neuronillas, habitantes de este mundo, de las fechorías de Fluorón, un ser que odia el conocimiento y la paz, quien junto a sus súbditos los Meralx juraron destruir a las neuronillas. Para combatir a Fluorón, se integrarán aspirantes que tendrán como objetivo convertirse en los nuevos Protectores de la Ciencia, pero primero tendrán que superar 30 pruebas dispersas por el mundo de Cerebronia. Kepler y Tesla, protectores veteranos (videojuegos Protectores de la Ciencia 2014-2015), serán los guías que enseñen a utilizar el método científico para resolver las misiones.

Protectores de la Ciencia Método Científico, es una secuela del videojuego Protectores de la Ciencia, el cual aborda contenidos de aprendizaje de la asignatura de Ciencias Naturales, en los ejes temáticos de Ciencias de la Vida y Ciencias Físicas y Químicas.

Este videojuego fue pensado para apoyar y reforzar la comprensión del método científico indagatorio, el cual es el pilar fundamental de la asignatura y es esencial para el desarrollo de las habilidades y etapas de la investigación científica presentes en los proyectos escolares.