海兰王国与迪南湖沿岸的琼斯顿都市同盟彼此对立，战争不断。养父玄客是昔日的英雄，不久前去世。主人公和义姊奈奈美居住在海兰王国边境小镇卡罗街。
主人公和他最好的朋友乔伊告别亲友，成为独角兽少年军的一员。停战协议签订后，双方各自退军。正当少年军撤走的最后一夜，遭遇不明的袭击，全军覆没。王国声称这是都市同盟蓄意的行为，因而撕毁停战协议，展开报复。
侥幸生存的二人返回故乡，却被指控为出卖国家的叛徒，幸好在处决前被救出，寄居于佣兵团中。随着王国大军的入侵，佣佣兵山寨失守沦陷，二人再度逃亡。途中获得了始之纹章的认同，被赋予改变命运的力量，各自被授予一半的始之纹章。
主人公附宿了辉盾纹章，乔伊则附宿黑刃纹章。他们没有想到，获得力量的同时，也卷入纹章之间的争斗，各自走向不同的道路……